История транспортной группы ENRC Logistics началась в 1991 году с момента основания ТОО «Международная экспедиторская компания «Транссистема»». Первоначально компания работала как научно-внедренческое предприятие, а в 1993 г. вышла на рынок транспортно-экспедиторских услуг, специализируясь на доставке грузов «от двери до двери» всеми видами транспорта. Сформировавшись, как стабильная и профессиональная компания,  «Транссистема» стала в 1999 году транспортным агентом всех промышленных предприятий Евразийской Промышленной Ассоциации (ЕПА), объединяющей такие предприятия, как АО «ТНК Казхром», АО «Алюминий Казахстана», АО «ССГПО», АО «Евроазиатская энергетическая корпорация» и пр.

Для организации эффективного, качественного транспортного обслуживания предприятий Евразийской группы, в 2000 году был приобретен первый подвижной состав, управление которым взяло на себя вновь созданное предприятие (г. Алматы). Далее, транспортную группу пополнили в 2003-2004 годах предприятия «ТрансРемВагон» (г. Рудный), осуществляющее капитальный и деповской ремонт грузовых вагонов широкой колеи и «Береке-2004» (г. Экибастуз), оказывающее услуги по ремонту локомотивов и путевой техники. В 2007 году с целью осуществления эффективного управления деятельностью предприятий транспортной группы было создано .

На текущий момент транспортная группа ENRC Logistics является центром логистики горно-металлургической корпорации ENRC, объединяющая лидирующие предприятия транспортной отрасли Казахстана и осуществляющая транспортировку более 50 млн. тонн грузов ежегодно.