В 2004 г. компания «Транссистема» пятый год подряд признается лучшей на национальном конкурсе «Выбор года» в Казахстане в номинации «Экспедитор № 1» и в пятый раз становится победителем на казахстанском конкурсе «Лучшая система управления» в номинации «Транспорт».

В декабре 2003 года компания была удостоена Национальной Премии Правительства Республики Казахстан «За достижения в области качества».